Kedu ihe bụ PDB File?

Esi emeghe, dezie ma gbanwee faịlụ PDB

Otu faịlụ nwere ndọtị faịlụ PDB nwere ike ịbụ faịlụ e kere na usoro nhazi usoro ihe omume nke ejiri ijide ozi nbibi gbasara usoro ma ọ bụ modul, dị ka faịlụ DLL ma ọ bụ EXE . Ha na-akpọ ha faịlụ akara.

Nbudata PDB depụtara mmiri dị iche iche na okwu dị na koodu ntinye ya na ngwaahịa ikpeazụ ya, nke onye na-arụ ọrụ ahụ nwere ike iji chọta faịlụ na isi ebe ọ ga-akwụsị usoro mbibi ahụ.

Ụfọdụ faịlụ PDB nwere ike kama ịnọ na file Protein Data Bank. Ụdị PDB ndị a bụ faịlụ ederede nke na-echekwa nhazi banyere protein.

A pụghị ịmepụta faịlụ PDB ọzọ na nkwụ Palm ma ọ bụ nchịkọta faịlụ PalmDOC ma were ya na sistemụ arụmọrụ nke PalmOS. Ụfọdụ faịlụ na usoro a jiri nchịkọta faịlụ .PRC kama.

Esi mepee PDB File

Usoro dị iche iche na-eji onwe ha PDB faịlụ iji chekwaa data na ụfọdụ ụdị ahaziri nchekwa data, otú ọ bụla ngwa na-eji emeghe ya onwe ya ụdị PDB faịlụ. Ebube, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, na Pegasus bụ naanị ihe atụ nke mmemme nwere ike iji faịlụ PDB dịka faịlụ nchekwa data. Radare na PDBparse nwere ike ịrụ ọrụ iji mepee faịlụ PDB kwa.

A na-echekwa faịlụ PDB dịka ederede ederede, dị ka Geneious 'Program Debug Database files, ma bụrụ mmadụ zuru ezu-ọ nwere ike ịgụta ya ma ọ bụrụ na ọ meghere ederede ederede. Ị nwere ike mepee ụdị faịlụ PDB na usoro ọ bụla nwere ike ịgụ akwụkwọ ederede, dị ka usoro a na-edeghị na Notepad na Windows. Ụfọdụ ndị na-ekiri faịlụ na ndị editọ PDB gụnyere Notepad ++ na Brackets.

Ndị ọzọ PDB faịlụ nchekwa data abụghị akwụkwọ ederede na ọ bụ naanị bara uru mgbe e meghere ya na usoro ihe omume ahụ. Dịka ọmụmaatụ, ọ bụrụ na faịlụ PDB nwere njikọ na ụzọ ụfọdụ na Quicken, mgbe ahụ gbalịa iji software ahụ ile ma ọ bụ dezie faịlụ PDB. Visual Studio na-atụ anya ịhụ faịlụ PDB na folda ahụ dịka DLL ma ọ bụ EXE faịlụ.

Ị nwere ike ịlele ma dezie faịlụ PDB ndị faịlụ nchekwa data Protein, na Windows, Linux, na MacOS na Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB, na USCF Chimera nwere ike mepee faịlụ PDB kwa. Ebe ọ bụ na faịlụ ndị a bụ ederede doro anya, ị nwere ike mepee faịlụ PDB na nchịkọta ederede.

Kọlọtọ Palm ga-enwe ike imeghe faịlụ PDB dị na nkwụ database faịlụ mana ị nwere ike ibu ụzọ nyegharịa ya iji nwee ndọtị faịlụ .PRC maka usoro ahụ iji mata ya. Iji mepee folda PalmDOC PDB, gbalịa STDU Viewer.

Olee otú iji tọghata PDB File

A pụghị iji faịlụ nchekwa data rụọ ọrụ ka ọ bụrụ na a gaghị atụgharị ya na ụdị faịlụ dị iche iche, ọ dịkarịa ala ọ bụghị ngwa faịlụ onye na-agbanwe agbanwe . Kama, ọ bụrụ na e nwere ngwá ọrụ ọ bụla nwere ike ịtụgharị ụdị ụdị PDB a, ọ ga-abụ otu usoro ahụ nwere ike imeghe ya.

Dịka ọmụmaatụ, ọ bụrụ na ịchọrọ iji tọgharịa faịlụ PDB gị site na Quicken, gbalịa iji usoro ahụ mee ya. Otú ọ dị, ụdị ntọghata a nwere ike ọ bụghị naanị ntakịrị ihe ozo kamakwa ọ naghị akwado na ngwa nchekwa data ndị a (yabụ na ị nwere ike ịgbanyeghị ụdị PDB a na usoro ọ bụla).

Enwere ike ịgbanwere faịlụ Bank Data Protein na usoro ndị ọzọ na MeshLab. Iji mee nke a, ị nwere ike ibido faịlụ PDB ozugbo na WRL na PyMOL site na Njikwa> Chekwaa Foto dị ka> VRML menu, wee bubata faịlụ WRL na MeshLab wee jiri Njikwa> Wepụ Mesh Dị ka menu iji megharịa PDB faịlụ na STL ma ọ bụ usoro faịlụ ọzọ.

Ọ bụrụ na ịchọtaghị ihe nlereanya ị ga-abụ na agba, ị nwere ike mbupụ faịlụ PDB ozugbo na STL na USCF Chimera (njikọ njikọ dị n'elu). Ma ọ bụghị ya, ị nwere ike iji otu ụzọ ahụ dị n'elu (na MeshLab) iji tọghata PDB ka WRL na USCF Chimera wee bubata faịlụ WRL na STL na MeshLab.

Iji tọghata PDB na PDF ma ọ bụ EPUB , ọ bụrụ na i nwere faịlụ PalmDOC, ọ ga-ekwe omume ọtụtụ ụzọ ma ọ kachasị mfe ka ọ bụrụ na ị na-eji onye na-agbanwe agbanwe na PDB dị ka Zamzar . Ị nwere ike bulite faịlụ PDB gị gaa na ebe nrụọrụ weebụ ahụ iji nweta nhọrọ nke ịtụgharị ya na usoro ndị ahụ yana AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT, na usoro faịlụ eBook ọzọ.

Iji tọghata PDB faịlụ na FASTA usoro nwere ike ime na Meiler Lab si online PDB ka FASTA onye ntụgharị.

Ọ dịkwa ike iji tọghata PDB ka CIF (Crystallographic Ozi Ọdịdị) online na-eji PDBx / mmCIF.

Ọgụgụ dị elu na faịlụ PDB

Ị nwere ike ịgụ ọtụtụ ihe gbasara faịlụ nchekwa data site na Microsoft, GitHub, na Wintellect.

E nwere ọtụtụ ihe ị ga-amụ banyere faịlụ Protein Data Bank kwa; lee World Bank Protein Data Bank na RCSB PDB.

Njikwa Gị Ọ Na-amaliteghị?

PDB faịlụ na-adịghị emeghe na nke ọ bụla nke ngwaọrụ si n'elu, eleghị anya na-abụghị n'ezie PDB faịlụ. Ihe nwere ike ime bụ na ị na-atụgharị ihe mgbatị faịlụ ahụ; ụfọdụ faịlụ faịlụ na-eji nkwụsị nke yiri ".PDB" mgbe ha na-enweghị njikọ na anaghị arụ ọrụ otu.

Dịka ọmụmaatụ, faịlụ PDF bụ faịlụ akwụkwọ kama ọtụtụ n'ime mmemme sitere na n'elu agaghị enye gị ederede na / ma ọ bụ foto n'ụzọ ziri ezi ma ọ bụrụ na ị gbalịrị imeghe otu na mmemme ngwanrọ ndị a. Otú ahụ ka ọ dịkwa maka faịlụ ndị ọzọ na ntinye akwụkwọ faịlụ ndị yiri ya, dika PD, PDE, PDC, na PDO faịlụ.

PBD bụ ihe ọzọ na-esite na EaseUS Todo Backup program ma ọ bụ ya mere ọ bara uru mgbe e meghere ya na ngwanrọ ahụ.

Ọ bụrụ na ịnweghị faịlụ PDB, chọpụta nchịkọta faịlụ nke faịlụ gị nwere ka ị nwee ike ịhụ usoro kwesịrị ekwesị nke ga-emepe ma ọ bụ na-agbanwe ya.